En las aplasias con más de dos criterios de gravedad la curva de supervivencia es bifásica, con alta mortalidad inial, antes de los tres meses y posteriormente un lento declive de la curva que corresponde a los pacientes que no consiguen alcanzar una remisión de la enfermedad. En general, son las complicaciones transfusionales, infecciosas y hemorrágicas las que condicionan la supervivencia.
Aunque se consiga una respuesta completa o parcial, esta enfermedad puede evolucionar a cuadros mielodisplásicos, incluyendo la hemoglobinuria paroxística nocturna, o la leucemia aguda.
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